ไนไตรต์ในน้ำเกิดจากการเน่าสลายของสารอินทรีย์ ไนไตรต์จะถูกดูดซึมเข้าสู่สัตว์น้ำทางเหงือกและทำปฏิกิริยากับฮีโมโกลบินในเลือด ทำให้ไม่สามารถถ่ายเทออกซิเจนได้ ส่งผลให้เกิดโรคเลือดสีน้ำตาลและอาจทำให้สัตว์น้ำตายได้ หากค่าไนไตรต์ที่วัดได้สูงกว่า 0.5 มก./ลิตร ถือว่าอยู่ในระดับที่ค่อนข้างอันตราย